Ricerca e sviluppo per nuovi paradigmi e algoritmi diagnostici nel controllo dell’infezione epidemica da SARS-CoV-2 (COVID-19) (MS&RNAextra4CoV)

La diffusione dell’infezione da SARS-CoV-2 ha reso necessaria la disponibilità di sistemi diagnostici ad elevata sensibilità e specificità che rispondano a criticità quali:

• Diagnosi urgenti con metodi rapidi;

• Diagnosi di routine, con risposta tempestiva o entro 24h (sospetto di COVID, verifica di negativizzazioni, approfondimenti diagnostici);

• Sorveglianza sanitaria, con risposta entro 36 ore (personale sanitario, contatti di casi COVID).

L’obiettivo del progetto MS&RNAextra4CoV è stato quello di sviluppare protocolli mirati a velocizzare o integrare le procedure attualmente in vigore per la diagnosi diretta dell’infezione da SARS-CoV-2 (COVID-19).

Al momento della scrittura progettuale, la metodica ufficiale nei laboratori di diagnostica era essenzialmente basata sull’ estrazione del RNA virale da tamponi rino-faringei e la successiva analisi in RT-PCR.

Il progetto si proponeva di sviluppare un workflow che, partendo dalla soluzione di conservazione del tampone contenente il virus, ottimizzi un protocollo di preparazione del campione per la successiva analisi RT-PCR, alternativo all’estrazione dell’RNA, prevista nel protocollo classico, al fine di ridurre i tempi diagnostici per la valutazione della positività a COVID-19.

In parallelo si mirava allo sviluppo ed alla messa a punto di nuovi metodi di spettrometria di massa (MS) per la valutazione della positività a COVID-19.