Laboratorio proteomica e Immunodiagnostica

Il laboratorio di Proteomica e Immunodiagnostica di Porto Conte Ricerche rappresenta attualmente uno dei laboratori più completi in Italia.
Grazie alla completezza delle diverse piattaforme strumentali di cui dispone, è in grado di separare, identificare e caratterizzare le proteine e i peptidi presenti in qualsiasi matrice, oltre a sviluppare nuovi sistemi diagnostici in base alle esigenze e agli obiettivi progettuali.

Il laboratorio offre servizi di ricerca e consulenza in diversi ambiti, tra cui:

● estrazione e separazione di proteine e peptidi con i principali protocolli utilizzati in proteomica e ottimizzati nel laboratorio in funzione della matrice di interesse;
● identificazione delle proteine attraverso spettrometria di massa ad alta risoluzione e i principali software per analisi degli spettri di massa interfacciati a specifici database;
● analisi differenziale del proteoma con approccio label-free o label-based (TMT) e con metodiche   gel-free o gel based;
● caratterizzazione e analisi funzionale delle proteine differenziali mediante i principali tool;
● validazione dei marcatori peptidici e proteici con tecniche immunochimiche (ELISA, western immunoblotting e dot blot);
● purificazione di proteine mediante tecniche cromatografiche;
● sintesi e purificazione di peptidi;
● sviluppo di metodi diagnostici basati su spettrometria di massa targeted e su saggi immunochimici, sia di tipo lab-based (ELISA), che point-of-care (“test rapido” di tipo immunocromatografico o biosensoristico);
● sviluppo di metodologie di analisi inter-omiche, attraverso l’integrazione dei dati (meta)proteomici con i dati (meta)genomici ottenuti dal Laboratorio di Genetica Molecolare.

Il laboratorio è dotato della seguente strumentazione:

● sistemi ad alta processività per SDS-PAGE, 2D-PAGE (Ettan IPGphor 3, EttanDalt Six, Ettan DALT twelve, HPE BlueTower) e ImmunoBlotting (Trans-Blot Turbo);
● sistemi di imaging per analisi di proteomica differenziale e immunoproteomica (VersaDoc 4000 MP);
● spettrometri di massa ad alta risoluzione (LTQ Orbitrap Velos, Q-Exactive) interfacciati con un sistema di cromatografia liquida ad ultra-high performance, che opera a nanoflussi (UHPLC Ultimate 3000);
● sintetizzatore automatico di peptidi a microonde (Liberty Microwave Peptide Synthesizer);
● sistemi di cromatografia liquida FPLC ed HPLC (AKTA explorer, HPLC 1100 e 1200 series);
● stazione robotizzata per saggi immunochimici (Freedom EVO) e lettore di micropiastre in assorbanza e in fluorescenza (Infinite F200);
● strumentazione BioDot ad alta precisione per lo sviluppo e la produzione su piccola scala di test rapidi di tipo immunocromatografico (ZX10100 Dispensing Platform, LM5000 Laminator, CM5000 Guillottine Cutter);
● strumentazione generica da laboratorio (pHmetro, bilancia analitica, centrifughe, thermomixer, Tissue Lyser, SpeedVac vacuum concentrator, agitatori, bagno termostato, sonicatore, liofilizzatore, sistema di purificazione dell'acqua, ultrafreezer).

Responsabile: Dott.ssa Daniela Pagnozzi (e-mail: [email protected])

Referente: Dott. Salvatore Pisanu (e-mail: [email protected])